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Outils de gestion bibliographique

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EndNote

Tutoriel Endnote X8

Pour chercher des références sur PubMed et les ajouter à la library

Bouton Integrated library & online search mode

Remplir les cases de recherche par auteur, année et/ou titre

Choisir le site de recherche comme PubMed

Cliquer sur Search

Sélectionner les références trouvées

Cliquer sur Copy to local library

Pour visualiser la library

Se placer sur My library, all references

Pour visualiser les informations attachées à une référence

Sélectionner la référence dans Endnote

Se placer sur le panneau de droite

Les attributs de la référence sont listés.

On a accès au pdf en passant par l’URL affichée

Pour insérer une référence dans un texte Word

Se placer au bon endroit dans le texte

Dans Endnote, sélectionner la référence et cliquer sur Insert citation

La référence s’insère dans le texte et est récapitulée à la fin du texte

A tout moment, une référence peut être ajoutée et la modification sera prise en compte automatiquement.

Pour choisir le style de la bibliographie

Dans Word, dans le menu Style, sélectionner le format désiré

La liste des références dans le texte et en fin de texte adopte le format choisi

Pour enregistrer la library

Dans le menu déroulant File, choisir enregistrer une copie

Au final voici ce que l’on obtient dans le texte Word

Montius(1) nos tumore inusitato quodam et novo ut rebellis et maiestati(2) recalcitrantes Augustae per haec quae strepit incusat iratus nimirum quod contumacem praefectum, quid rerum ordo postulat ignorare dissimulantem formidine tenus iusserim custodiri.Montius (3)nos tumore inusitato quodam et novo ut rebellis et maiestati(4) recalcitrantes Augustae per haec quae strepit incusat iratus nimirum quod contumacem praefectum, quid rerum ordo postulat ignorare dissimulantem formidine tenus iusserim custodiri.

1. S. S. Edwards et al., An in vitro method for studying subcellular rearrangements during cell polarization in Drosophila melanogaster hemocytes. Mech Dev 154, 277-286 (2018).D. C.

2. Fong et al., Selective in vivo recruitment of the phosphatidylinositol phosphatase SHIP by phosphorylated Fc gammaRIIB during negative regulation of IgE-dependent mouse mast cell activation. Immunol Lett 54, 83-91 (1996).

3. L. Stankevicins et al., Deterministic actin waves as generators of cell polarization cues. Proc Natl Acad Sci U S A 117, 826-835 (2020).

4. D. Obino, A. M. Lennon-Dumenil, A critical role for cell polarity in antigen extraction, processing, and presentation by B lymphocytes. Adv Immunol 123, 51-67 (2014).

 

 

Zotero

Zotero est un logiciel de gestion de références bibliographiques gratuit, libre et open source. Il permet de gérer des données bibliographiques et des documents de recherche. Il s’agit d’une application qui fonctionne sur les systèmes d’exploitation Mac, Windows et Linux, avec un connecteur qui s’installe en tant qu’extension sur le navigateur   – Mozilla Firefox, Safari ou Google Chrome.

Installer Zotero et Zotero Connector

Depuis la page download du site Zotero (https://www.zotero.org/download/)

  • Installer le logiciel Zotero

Téléchargez la dernière version de Zotero en cliquant Download. Un module complémentaire pour Word s’installera automatiquement.

  • Installer Zotero connector

Assurez-vous que l’extension Zotero Connector soit bien installée, selon votre navigateur Firefox, Chrome ou Safari. Le bouton (module complémentaire) s’affichera dans votre navigateur à droite de la barre d’adresse.

Configuration des liens permettant d’accéder directement aux ressources de l’Inserm 

Pour avoir accès aux ressources Insermbiblio, configurer le logiciel Zotero et Zotero Connector comme suit :

Saisie du résolveur de liens dans Zotero

Depuis le logiciel Zotero

Edition > Préférences > Avancées > onglet Générales

Résolveur de liens : http://resolver.ebscohost.com.proxy.insermbiblio.inist.fr/openurl

 Saisie de l’adresse EZproxy du serveur dans le connecteur Zotero

Depuis Zotero Connector – clic droit –  accédez aux préférences de Zotero Connector :

  • Firefox : faites un clic droit sur le Connecteur Zotero > Preferences;
  • Chrome : faites un clic droit sur le Connecteur Zotero  > Options;
  • Safari : cliquez et maintenez le Connecteur Zotero > Preferences.

Depuis Zotero connector dans l’onglet Proxies :

Configured Proxies : %h.proxy.insermbiblio.inist.fr/%p

Configuration des préférences afin d’éviter tout téléchargement excessif

Depuis Zotero Connector, dans l’onglet General

Décocher obligatoirement Automatic File Importing

Pour les utilisateurs d’EndNote, ce paramétrage permettra par ailleurs de choisir le programme de destination lors de l’importation de leurs références.

Récupérer en ligne les références via Insermbiblio

Une fois ces paramètres entrés, Zotero est en lien avec Insermbiblio. Il est possible de retrouver en ligne les références enregistrées :

> Recherche dans la bibliothèque

On est alors redirigé vers la page d’authentification d’Insermbiblio.

Après avoir entré les identifiants, l’utilisateur sera redirigé vers le résolveur de liens qui donnera accès à la ressource en ligne.

Documentation

Vous pouvez retrouver toute la  documentation de Zotero sur cette page : https://www.zotero.org/support/fr/start

Papers

Papers est un logiciel de gestion de références bibliographiques. Il permet de gérer des données bibliographiques et des documents de recherche. Il s’agit d’une application qui fonctionne sur les systèmes d’exploitation Mac et Windows.

Configuration de Papers

>Papers > My account

Institution > Edit

Institution : Insermbiblio

Manually enter a proxy URL : http://proxy.insermbiblio.inist.fr/login?url=%

Récupérer en ligne les références via Papers

L’extension ReadCube |Papers

L’extension Papers permet, lors d’une recherche sur une plateforme, d’enregistrer les références et les fichiers pdf dans la librarie Papers. Ici, dans une recherche sur Pubmed :